Hỏi: Công trình hoàn thành trước hạn thanh toán thế nào?

Công ty của tôi thực hiện gói thầu tư vấn, khảo sát lập thiết kế bản vẽ thi công dự toán xây dựng công trình, loại hợp đồng theo đơn giá điều chỉnh, thời gian thực hiện hợp đồng là 90 ngày, giá hợp đồng phần khảo sát là 2 tỷ đồng và phần thiết kế là 6 tỷ đồng. Trong bảng tiên lượng dự thầu, nhà thầu diễn giải thời gian thực hiện của gói thầu, bố trí nhân sự trong 90 ngày. Tuy nhiên chỉ sau 45 ngày nhà thầu đã thực hiện xong công việc và bàn giao hồ sơ cho chủ đầu tư. Khi thanh toán, chủ đầu tư giảm trừ ½ giá trị phần thiết kế với lý do thời gian thực hiện chỉ bằng ½ so với thời gian trong tiên lượng dự thầu. Nhà thầu không đồng ý do đây không phải là hợp đồng theo thời gian. Tôi xin hỏi, cách làm của chủ đầu tư có đúng quy định không? Vấn đề trên được giải quyết như thế nào?