Hỏi: Căn cứ tính và truy thu tiền cấp quyền khai thác tài nguyên nước

Công ty tôi có nhà máy điện phân chì kẽm nằm trên địa bàn tỉnh Bắc Kạn. Năm 2019, công ty được UBND tỉnh Bắc Kạn cấp giấy phép khai thác sử dụng nước mặt với mục đích khai thác là cấp nước cho hoạt động sản xuất và sinh hoạt của nhà máy; thời hạn 10 năm (01/9/2019-01/9/2029). UBND tỉnh cũng đã ban hành quyết định phê duyệt tiền cấp quyền khai thác tài nguyên nước của nhà máy, giá tính tiền cấp quyền là: 3.000 đồng/m3. Căn cứ tính tiền cấp quyền khai thác tài nguyên nước là Nghị định số 82/2017/NĐ-CP ngày 17/7/2017 của Chính phủ quy định chi tiết thi hành về phương pháp tính, mức thu tiền cấp quyền khai thác tài nguyên nước. Giá tính tiền cấp quyền là giá tính thuế tài nguyên đối với nước thiên nhiên dùng cho mục đích khác (làm mát, vệ sinh công nghiệp, xây dựng, dùng cho sản xuất, chế biến thủy sản, hải sản, nông sản,…) Ngày 30/3/2021, Chính phủ ban hành Nghị định số 41/2021/NĐ-CP sửa đổi, bổ sung một số điều của Nghị định số 82/2017/NĐ-CP, trong đó tại khoản 4 Điều 1 có quy định như sau: "c) Giá tính tiền cấp quyền khai thác tài nguyên nước cho cơ sở khai thác, chế biến khoáng sản, cưa cắt đá là giá tính thuế tài nguyên nước thiên nhiên dùng cho khai khoáng;". Theo đó, giá tính tiền khai thác nước đối với nhà máy điện phân chì kẽm của công ty tôi là giá tính thuế tài nguyên đối với nước thiên nhiên dùng cho mục đích khai khoáng (cao hơn khoảng 13 lần so với giá tính tiền tại quyết định phê duyệt trước đó của UBND tỉnh). Sở Tài nguyên và Môi trường đã đề nghị công ty lập hồ sơ điều chỉnh giấy phép khai thác sử dụng nước mặt được cấp từ năm 2019 và kê khai để tính lại tiền cấp quyền khai thác tài nguyên nước. Công ty đã lập hồ sơ đề nghị điều chỉnh giấy phép và được UBND tỉnh cấp giấy phép khai thác nước mặt điều chỉnh vào ngày 26/9/2024. Đồng thời, ngày 24/11/2024, UBND tỉnh cũng ban hành quyết định điều chỉnh tiền cấp quyền khai thác nước của công ty. Giá tính tiền cấp quyền là: 40.000 đồng/m3. Căn cứ tính tiền cấp quyền khai thác tài nguyên nước là Nghị định số 54/2024/NĐ-CP. Sau đó, Sở Tài nguyên và Môi trường lại tiếp tục đề nghị công ty lập và nộp hồ sơ truy thu tiền cấp quyền khai thác tài nguyên nước đối với lượng nước khai thác, sử dụng theo giấy phép khai thác nước cấp từ năm 2019. Thời gian tính tiền truy thu từ khi Nghị định số 41/2021/NĐ-CP có hiệu lực (ngày 15/5/2021) đến ngày UBND tỉnh ban hành giấy phép khai thác nước điều chỉnh ngày 26/9/2024. Tôi xin hỏi, nhà máy điện phân chì kẽm của công ty tôi có thuộc trường hợp bị truy thu tiền cấp quyền khai thác quy định tại khoản 3 Điều 52 Nghị định số 54/2024/NĐ-CP hay không?